تقوم فلسفة عمل المصارف الإسلامية على عدد من القواعد والأسس من أهمها:
1. منع التعامل بالفائدة (الربا) أخذاً أو إعطاءً.
2. مبدأ الغنم بالغرم، أي المُشاركة بالربح والخسارة.
3. مبدأ:النقود لا تلد نقود،أي أن النقود لا تنمو إلاّ بفعل استثمارها، وأن هذا الاستثمار يكون مُعرضاً للمخاطر، وفي ضوء ذلك فإن نتيجة الاستثمار قد تكون ربحاً أو خسارة.
4. التعامل بصيغ التمويل الإسلامية من مُشاركة، مُضاربة، مُرابحة، بيع السلم، وغيرها من صيغ التمويل.
5. توجيه المدخرات إلى المجالات التي تخدم التنمية الاقتصادية والاجتماعية.
6. ربط أهداف التنمية الاقتصادية بالتنمية الاجتماعية وأن للمصرف الإسلامي دور في تحقيق هذه التنمية.